Система должна быть введена в эксплуатацию не позднее 1 января 2020 года.Первую очередь ГИС ТЭК предполагается ввести в эксплуатацию в начале октября 2019 года, при этом Минэнерго совместно с Российским энергетическим агентством, выполняющим функции оператора системы, уже провело комплекс подготовительных мер для ввода ГИС ТЭК. С мая 2019 года Российское энергетическое агентство совместно с рядом уже зарегистрировавшихся компаний проводит опытную эксплуатацию системы. На данный момент в системе зарегистрировано 630 юридических лиц, входящих в 43 холдинга из всех отраслей ТЭК. Для работы с компаниями агентство создало колл-центр и запустило портал ГИС ТЭК. Кроме того, практически завершены актуализация нормативно-правовой базы в сфере создания, эксплуатации и совершенствования ГИС ТЭК и доработка программно-аппаратного комплекса самой системы. В свою очередь, участвующие в работе ГИС ТЭК компании адаптируют информационные системы к требованиям законодательства. Предварительные итоги опытной эксплуатации ГИС ТЭК были подробно разобраны на совещании с участием компаний под председательством министра энергетики Александра Новака 16 июля.
Система станет основой для единого информационного поля, в котором будет содержаться официальная и взаимоувязанная информация о состоянии и развитии отраслей ТЭК, необходимая для реализации задач государственной энергетической политики.